真核生物中染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位是核小體,其由146bp的DNA纏繞組蛋白八聚體1.75圈形成。每個(gè)核小體又是由兩個(gè)亞基構(gòu)成的,而每個(gè)亞基包括H2A、H2B、H3和H4這四個(gè)組蛋白。組蛋白尾部的蛋白結(jié)構(gòu)域富含帶正電荷的堿性氨基酸,能夠與DNA中帶負(fù)電荷的磷酸基團(tuán)相互作用。其最N末端部分不參與核小體組裝,而是從核心結(jié)構(gòu)中突出,更適合與相鄰環(huán)境進(jìn)行相互作用,因此易受翻譯后修飾(PTM)的影響。在四種不同的組蛋白質(zhì)中,組蛋白H3和H4的尾部比H2A和H2B更容易發(fā)生PTM。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTM) 通過(guò)功能基團(tuán)或蛋白質(zhì)的共價(jià)添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個(gè)蛋白質(zhì)的降解來(lái)增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙酰化、脂質(zhì)化和蛋白水解,幾乎影響正常細(xì)胞生物學(xué)和發(fā)病機(jī)制的所有方面。組蛋白PTM抗體是表觀遺傳學(xué)研究(如染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)、免疫染色和免疫印跡)中的關(guān)鍵元素。然而,許多抗體不能特異識(shí)別預(yù)定目標(biāo)。此外,目前市面上的組蛋白抗體以多克隆抗體居多,在使用前需要廣泛驗(yàn)證。EpiCypher在CUT&RUN和CUT&Tag中篩選了數(shù)百種抗體,并通過(guò)了獨(dú)有的SNAP-Certification技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證,為研究者提供了可識(shí)別經(jīng)過(guò)修飾的組蛋白和相關(guān)細(xì)胞靶點(diǎn)的組蛋白PTM抗體。
特異性
準(zhǔn)確的CUT&RUN和CUT&Tag分析需要特異性抗體。標(biāo)準(zhǔn)驗(yàn)證方法無(wú)法區(qū)分特異性與非特異性PTM抗體。即使是被高度引用的抗體也無(wú)法滿足對(duì)靶向分析的最低期望(見(jiàn)下圖)。SNAP-Certification抗體的交叉反應(yīng)性低于20%,確保了精確可靠的數(shù)據(jù)。
高效性
高效的CUT&Tag和CUT&RUN抗體可以從減少的細(xì)胞數(shù)中進(jìn)行可靠的定位。SNAP-Certification抗體經(jīng)過(guò)高效驗(yàn)證,可在細(xì)胞滴定中產(chǎn)生可重復(fù)的譜圖。
SNAP-Certified?抗體具有多重優(yōu)勢(shì): 更優(yōu)越的靶向特異性和親和力 交叉反應(yīng)性低 CUT&RUN和CUT&Tag性能穩(wěn)定 提高低細(xì)胞數(shù)的PTM分析 通過(guò)特定批次的測(cè)試提高可靠性
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新產(chǎn)品推薦
產(chǎn)品名稱 | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
H3K27me3 Antibody, SNAP-Certified? for CUT&RUN and CUT&Tag | 13-0055 |
100 μg |
H3K36me3 Antibody, SNAP-Certified? for CUT&RUN | 13-0058 | 100 μg |
H3K4me1 Antibody, SNAP-Certified? for CUT&RUN and CUT&Tag | 13-0057 | 100 μg |
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