基于需要遞轉不同種類核酸/蛋白類型研究,在細胞轉染環(huán)節(jié),研究者們常碰到如下三類問題:
1、細胞對化學試劑較為敏感,轉染后,細胞活率下降或死亡;
2、研究常用細胞類型較多,不同類型細胞,轉染效率差異較大,導致單個轉染試劑或者實驗流程,無法滿足實驗需求;
3、遞轉多種類型核酸或蛋白,需要挑選對應的轉染試劑,并且需要大量實驗優(yōu)化,才可以得到較高的轉染效率。
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有沒有一款化學轉染試劑,可以同時應對常規(guī)到難轉染的細胞類型,有著較低的細胞毒性,并且適用于多種核酸/蛋白類型遞轉呢?兼具多重功能、高性能的TransIT-X2?轉染試劑,可同時應對常見細胞及難轉染細胞類型,避免條件摸索、大量的重復性實驗,輕松地得到您理想的實驗結果。
● 已驗證在大多數細胞類型中(如貼壁/懸浮細胞、原代細胞、神經細胞等),都有著優(yōu)異的轉染效率、低毒性(特別相對于形成脂質體復合物的Lipofectamine?系列試劑)、高性能的表現;
● 適用于多種研究領域,包括不限于干細胞研究、基因編輯CRISPR研究、RNAi基因干擾/沉默、穩(wěn)轉細胞株構建、低毒性的轉染實驗、共轉染實驗等;
● 允許高效且穩(wěn)定的同時遞轉多種核酸/蛋白類型,包括不限于質粒 DNA、siRNA/miRNA 和 CRISPR/Cas9 組分。
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圖1、Mirus產品年鑒
為什么 Mirus TransIT-X2? Dynamic Delivery System (請見訪問鏈接:https://www.mirusbio.com/product/transit-x2-dynamic-delivery-system-0-3-ml-0-3-ml/ )有著如此高性能及廣泛適應性呢?這歸因于Mirus強大且高效的專利遞轉平臺設計,可進行多重、多功能組合的轉染試劑組分篩選并優(yōu)化。成立于1995年的Mirus,專注及深耕核酸遞轉領域多年,從最早具有低毒性的TransIT ? -LT1到GMP級別、可用于AAV和LV生產的TransIT-VirusGEN?,都是基于該遞轉平臺進行設計及開發(fā)。直至文稿發(fā)布時,使用Mirus產品發(fā)表文章已超過1萬篇,并且發(fā)表文章及Mirus數據庫涵蓋了超過1千2百種細胞類型,更多文章及數據查詢,請見訪問鏈接:https://www.mirusbio.com/citation-search/。
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圖2、Mirus轉染試劑原理示意圖
不同于傳統(tǒng)基于單組分的轉染試劑(如陽離子聚合物或陽離子脂質體),為了進一步提高轉染效率,以應對不同細胞類型或特定的應用。Mirus將專利的多聚物(Polymer)及脂質(Lipids)技術進行多重組合,在不形成脂質體復合物(liposome,通常具有細胞毒性)前提條件下,得到多種類、高性能的轉染方案,克服細胞遞轉過程中的多重阻礙,以實現更高效轉染和更低的細胞毒性(圖2)。
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圖3、Mirus獨有智能迭代設計,轉染試劑優(yōu)化流程示意圖
基于上述Mirus強大、高效的專利遞轉平臺設計,在進行多重、多組合篩選、優(yōu)化及后續(xù)驗證。獨有的智能迭代設計流程,優(yōu)化轉染技術中的每個組分。Mirus推出一系列經典轉染試劑,以應對多種需求:
1、廣譜、高性能、低毒性的轉染試劑家族: TransIT-X2?、TransIT?-LT1、TransIT?-2020
2、針對特定細胞類型的轉染試劑家族:TransIT?-293、TransIT?-BrCa、TransIT?-CHO、TransIT-HeLaMONSTER?、TransIT?-Insect、TransIT?-Jurkat、TransIT?-Keratinocyte
3、針對特定應用的轉染試劑家族:
★.病毒生產:VirusGEN? 轉染試劑及配套試劑盒、TransIT?-Lenti
★.蛋白/抗體生產:TransIT-PRO?、CHOgro? Expression System、CHOgro? High Yield Expression System
4、寡核苷酸遞轉的轉染家族:TransIT?-Oligo、TransIT-siQUEST?、TransIT-TKO?
5、mRNA及長鏈RNA遞轉:TransIT?-mRNA
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? Mirus TransIT-X2??轉染試劑性能數據 展示圖??
4、TransIT-X2?Dynamic Delivery System在包括原代細胞多種細胞類型中,具有較高轉染效率。
Mirus TransIT-X2?Dynamic Delivery System遞轉表達EGFP質粒DNA分別至A549、CHO-K1、Hep G2、MDCK、LNCaP、PC-12、原代人乳腺上皮細胞(HMEC)和正常人真皮成纖維細胞(NHDF)細胞中。實驗使用96孔板, TransIT-X2?試劑加入量為0.2-0.4μl,DNA加入量為0.1μg(使用試劑:DNA=2:1、3:1或4:1)。轉染后48小時,使用Guava? easyCyte? 5HT流式細胞儀重復檢測三次,評估轉染效率。
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圖5、相較于使用單一組分且形成陽離子脂質體復合物(liposome)的Lipofectamine?系列轉染試劑,TransIT-X2?有著更高的轉染效率及更低細胞毒性
使用TransIT-X2?(Mirus Bio)、Lipofectamine?2000 (Thermo Fisher Scientific)或Lipofectamine?3000 (Thermo Fisher Scientific)轉染熒光素酶編碼質粒DNA至A549 (A)或MDCK (B)細胞中,轉染24小時,通過熒光素酶活性評估轉染效率,定量受損細胞中釋放的LDH評估細胞毒性。與Lipofectamine?2000或Lipofectamine?3000的細胞相比,在最佳試劑:DNA比例下,Trans - x2?有著更高的熒光強度及更低的細胞毒性。
實驗Tips: 針對更多特定細胞類型,試劑使用建議,詳細請見:https://hub.mirusbio.com/m/d6a018920beec12e/original/Protocol-Optimization-Card.pdf
? Mirus TransIT-X2??在RNAi干擾實驗中性能數據展示??
圖6、不同RNAi干擾途徑示意圖
基因沉默相關功能研究在分子和細胞生物學中發(fā)揮著重要作用,化學轉染也在該研究領域扮演者重要角色。常見參與RNAi干擾途徑的天然RNA分子包括:
★.小干擾 RNA (Small interfering RNAs, siRNA) :由雙鏈 RNA(dsRNA)斷裂所產生的短雙鏈 RNA(20-25bp);
★.微小 RNA(MicroRNAs, miRNAs) :非編碼 RNA 處理后所產生的一類短的、單鏈 RNA(20-22nt)。
利用 RNAi 抑制基因表達的另一種方法為短發(fā)夾 RNA(short hairpin RNA , shRNA),這些短 RNA 序列可通過病毒或非病毒載體方式進行表達,更多詳細信息可查閱Mirus Applications | RNAi Gene Silencing。
請見訪問鏈接:https://www.mirusbio.com/applications-rnai-gene-silencing/
圖7、基于siRNA核酸遞轉類型的基因沉默研究,相比Lipofectamine? 2000,TransIT-X2?有著更高的基因沉默效率
TransIT-X2?Dynamic Delivery System和Lipofectamine?2000轉染試劑用于轉染siRNA(靶點為內源性蛋白質- GAPDH和AHA1),對照使用正常人類真皮成纖維細胞(NHDF)遞轉非靶向siRNA。Trans IT-X2?加入量為4μl, Lipofectamine?2000加入量為6μl,siRNA加入量都為25 nM。使用qRT-PCR相對于18s rRNA水平測量GAPDH或AHA1 mRNA進行檢測,轉染后48小時均一化至非靶向對照組的mRNA水平,誤差則為三次復孔實驗的標準差。
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圖8、基于miRNA (miRNA Precursor及miRNA mimic)基因沉默研究,相比Lipofectamine? 2000,TransIT-X2?有著更高的基因沉默效率
TransIT-X2?Dynamic Delivery System和Lipofectamine?2000轉染試劑用于轉染Pre-miR? hsa-miR-1 miRNA Precursor 或者mirVana? miRNA mimic, miR-1 (兩者都已驗證,可降低PTK9 mRNA表達水平)。Pre-miR?陰性質控用于評估mRNA表達水平基線值。Trans IT-X2?及Lipofectamine?2000試劑加入量都為3μl, 加入50 nM miRNA。使用qRT-PCR相對于18s rRNA水平,經過陰性質控的均一化,得到PTK9 mRNA表達水平值。
? Mirus TransIT-X2??在CRISPR基因編輯實驗中性能數據展示??
經過改造及優(yōu)化的細菌 CRISPR/Cas9 系統(tǒng),已被廣泛應用到哺乳細胞的基因編輯中?;?/span>CRISPR基因編輯實驗常見兩組分:Cas9蛋白及引導RNA(gRNA)。當Cas9蛋白切割了靶向基因組DNA,會觸發(fā)兩種內源性修復機制,即非同源末端連接(NHEJ)和同源定向修復(HDR),以應對細胞中產生的DNA斷裂?;?/span>NHEJ細胞修復通路,為非精準、且容易出錯細胞修復通路,可引入導致基因功能缺失的Indel?;?/span>HDR的細胞修復通路,則需要額外的同源 DNA 作為修復模板,從而實現“精準”修復,在目的基因插入特定的基因或長片段序列。
【 根據研究者們不同的實驗需求 】?
CRISPR基因編輯可以有多種類型實驗設置,這意味需要面對不同核酸類型的轉染甚至共轉染,舉例如下:
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1、質粒pDNA轉染
作為CRIPSR實驗關鍵兩組分:Cas9蛋白及gRNA,可以設計單個質粒DNA,共同表達兩組分(A);或者使用兩質粒系統(tǒng),其中一個質粒表達Cas9蛋白,另外一個質粒表達gRNA(B);當使用Cas9切口酶(Nickase),則需要兩條gRNA,這時可能需要三質粒系統(tǒng)的遞轉實驗。
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2、質粒DNA及RNA寡核苷酸共轉染
此時,與上述實驗設計不同的是,gRNA以寡核苷酸形式進行遞轉,這就意味著遞轉實驗需要同時轉染質粒DNA以及RNA寡核苷酸(A和B)。
3、mRNA及RNA寡核苷酸共轉染
為了避免由于質粒DNA基因組整合而導致的脫靶效應,可以共轉染編碼Cas9蛋白的mRNA及gRNA (RNA寡核苷酸)。
4、Cas9/gRNA RNP復合物遞轉
隨著Cas9蛋白及gRNA商品化趨于成熟,越來越多的研究者們選擇直接從第三方購買高保真Cas9蛋白,以及有著額外化學修飾且在細胞內更穩(wěn)定的gRNA寡核苷酸。除了極大的縮短和簡化CRISPR實驗流程外,相對于質粒或者mRNA方式合成,直接遞轉RNP復合物的方式有著更高的特異性及編輯效率。
實驗Tips: 針對上述不同CRISPR實驗設計及遞轉情形,TransIT-X2? Dynamic Delivery System經優(yōu)化的具體實驗說明
下載鏈接如下:
https://tools.mirusbio.com/assets/technical-documents/transit-x2-dynamic-delivery-system-for-crispr-cas9-plasmid-and-grna-delivery.pdf
https://tools.mirusbio.com/assets/technical-documents/transit-x2-dynamic-delivery-system-for-crispr-cas9-plasmid-delivery.pdf
https://tools.mirusbio.com/assets/technical-documents/transit-x2-dynamic-delivery-system-for-crispr-cas9-rnp-ssodn-delivery.pdf
https://tools.mirusbio.com/assets/technical-documents/transit-x2-dynamic-delivery-system-for-crispr-cas9-rnp-delivery.pdf
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圖9、質粒DNA和gRNA寡核苷酸共轉染:TransIT-X2?分別在293T/17、U2OS和NHDF細胞中共轉Cas9質粒DNA與gRNA(RNA寡核苷酸),都有著較高的基因編輯效率(18-48%)
使用TransIT-X2? Dynamic Delivery System? (2 μl/孔,24孔板, Mirus Bio)共轉染0.5 μg質粒DNA(表達Cas9蛋白)及50nM 2-part gRNA (PPIB基因)至HEK293T/17, U2OS 及NHDF細胞中,轉染后48小時,T7E1驗證切割效率。
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圖10、Cas9/gRNA RNP復合體遞轉:相較于Lipofectamine?系列轉染試劑,TransIT-X2?有著更高的切割效率
2-part gRNA (PPIB基因,IDT) 及Cas9 蛋白(PNA Bio)形成RNP復合體,分別使用TransIT-X2? Dynamic Delivery System(1 μl/孔, Mirus Bio)、Lipofectamine? CRISPRMAX? (1.5 μl/孔, ThermoFisher) 、Lipofectamine? RNAiMAX (1.5 μl/孔, ThermoFisher) 、Lipofectamine? 3000 (1.5 μl/孔ThermoFisher) 遞轉至293T/17及U2OS細胞中。測試gRNA兩種使用量(6 nM或12 nM),相同Cas9 蛋白加入量(6 nM),轉染后48小時,T7E1驗證切割效率。
? Mirus TransIT-X2??產品優(yōu)勢??
?、新型基于多組分開發(fā)的廣譜型轉染試劑(適用于多種細胞,包括難轉細胞);
?、可同時轉染核酸及蛋白,包括不限于DNA,siRNA/miRNA和CRISPR/Cas9復合物;
?、不形成脂質體復合物,降低細胞毒性;
?、滿足多種應用:基因過表達、基因沉默、基因編輯、干細胞研究、穩(wěn)轉細胞株構建等。
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? 相關產品信息??
產品名稱 | 規(guī)格 | 貨號 |
TransIT-X2???Dynamic? Delivery System | 1×0.3ml | MIR6003 |
1×0.75ml | MIR6004 |
1×1.5ml | MIR6000 |
5×1.5ml | MIR6005 |
10×1.5ml | MIR6006 |
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